《尼尔：机械纪元》世界简史及故事背景分析

　　3287年， 复活的红眼持续进攻复制人，然而有着一名机器人和4名复制人的小队经过艰苦战斗最终除掉了红眼，同时地球上最后一点玛索残余也被清除成功，净化成功结束。

　　3288年，净化后人类灵魂逐渐苏醒，然而当他们找到自己的复制体想要植入灵魂时，复制人却把这些灵魂当成怪物(他们的外表就是shade)，人类(shade)和复制人的大战就此展开。然而也有少数机器人管理者统治的地方复制人成功接受了人类的存在，并且让他们在自己体内被唤醒，而这些人也成为了机械纪元里仅存人类的祖先(推测)。

　　3300~，尽管有尼尔提供玛索，没有找到身体的人类灵魂还是不停狂化，见此情况尼尔日渐怀疑尤娜究竟能不能被治好,他决定自己采取行动

　　尼尔R剧情故事

　　之后Nier Replicant游戏的故事发生，简单来说来自旧世界的机器人管理者Devola和Popola察觉到人类在狂化的威胁下濒临灭绝，无奈之下她们让照顾感染有黑纹病(1)的复制体尤娜的复制体尼尔找到白之书，寄希望融合白/黑两书能让人类灵魂强行植入复制人体内。随之复制体尤娜被魔王(尼尔本人)绑走，希望能将真尤娜的灵魂传输到复制品尤娜的身体里。为了救出尤娜，尼尔复制品联合了半人半shade的凯恩，看上去是个小男孩实为秘密武器的埃米尔花费5年时间找到了魔王，此时尤娜的灵魂已经进入了她的复制品身体中，但是感受到复制品对哥哥的思念，她放弃了占有就此死去。决战过后凯恩WCS发作，为了拯救凯恩尼尔复制品牺牲自己，醒来后的凯恩和尤娜就此彻底忘记了尼尔，仿佛他不曾存在过一般(结局D)，而魔王尼尔的死亡也让Gestalt计划彻底破产，所有原型人类失去玛索的供给加速死亡。